復合土工膜的鋪設，是該工程施工的關鍵。施工質量控制包括材料采購、進場原材料質量控制、施工操作過程控制、施工完畢質量檢測。
1、材料采購 結合工程實際及所選復合土工膜的規格，確定復合土工膜的質量標準、幾何尺寸，選擇生產規模較大、產品質量符合要求的生產廠家進行招標采購。
2、原材料質量控制 進場的復合土工膜必須有廠家提供的合格證書、出廠檢測合格報告等資料。復合土工膜進場后，隨機抽取復合土工膜對其性能指標委托實驗中心進行復測，復測結果全部合格。
3、焊接質量控制
復合土工膜鋪設前編好施工組織設計，說明鋪設方法和技術措施，經監理批準后方可使用。
嚴把質量關，進場后取樣進行檢測，不合格的土工膜嚴禁使用，必須清出施工現場。
復合土工膜的接頭施工前應先進行工藝試驗，取得焊接機械的行走速度、控制溫度等參數后才能進行施工。
復合土工膜鋪設要與保護層鋪設相協調，做到隨鋪隨壓。
拼接中復合土工膜焊縫質量是拼接關鍵，施工中尤其要加強接縫檢測，檢測方法有：目測法、現場檢漏。
搭接時，應遵循高處的膜壓在低處的膜面、按水流方向上游膜壓在下游膜面上的原則。土工膜頂部應錨固于封頂板的混凝土中，并壓在渠頂下土層中，以形成整體防滲層，其錨固長度應符合施工圖紙的要求。
4、焊接質量控制 現場檢驗應隨焊接進度先由施工單位
（乙方）自檢，自檢合格后提交監理和業主聯合抽樣檢驗或全檢。自檢和抽檢的數據、資料均應作為質量驗收依據。
5、現場檢測時遵守的規定
1.檢測完畢，應立即對檢測時所做的充氣打壓穿孔全部用擠壓焊接法補堵。
2.檢測工程及結果應詳細記錄并標示在施工圖上。
3.檢測人員應在檢測記錄上簽字并簽署明確結論、意見和建議。
4.對質檢不合格處應及時標記并補焊。經再驗合格后方可銷號并記錄在案。
5.質量保障小組應負責檢測的監督及管理。
6.應隨時保護已焊接合格的 PE 土工膜不受任何損壞。
7.對于虛焊、漏焊的接縫應及時補焊，并應對補焊部位進行真空檢測。

8.質量檢驗應隨施工進展進行，自檢合格后應經甲方抽檢或全驗，驗收合格后，方可進行下道工序。